上海海尼藥業有限公司創建于2001年9月11日，位于上海市浦東新區周浦鎮，緊鄰上海市國際醫學園區，是揚子江藥業集團在泰州外成立的第一家全資子公司。公司占地總面積約28萬平方米，總建筑面積7萬平方米，綠化率達47%，現有員工300余人。海尼藥業致力于向社會提供優質高效的藥品和健康服務，憑借優秀的創新研發與市場開拓力，產品銷售遍及中國30多個省市區，為上億患者提供健康醫療服務。2022年獲國家級“綠色工廠示范企業”和“綠色供應鏈”。

南京海陵藥業有限公司成立于2001年，是一家集藥物研發、生產與銷售為一體的高新技術企業。公司先后獲批國家工程技術研究中心、江蘇省企業技術研究中心、江蘇省博士后創新實踐基地和江蘇省工程研究中心，掌握藥物合成、藥物分析、藥物制劑等多項關鍵技術，處于國內領先水平。公司先后榮獲國家綠色工廠、南京市市長質量獎、江蘇省質量管理優秀獎、江蘇省小巨人企業（制造業）、江蘇省互聯網標桿工廠等稱號。

四川海蓉藥業有限公司成立于2001年，是揚子江藥業集團布局西南地區的重要戰略基地。目前有8個生產車間，10條生產線，30個品種，50個品規，產品涵蓋消化系統用藥、心腦血管用藥、抗腫瘤輔助用藥、抗感染用藥、激素類用藥、中藥制劑、直接口服飲片等。先后獲批成立企業博士后科研工作站、四川省企業技術中心、四川省院士（專家）工作站，被授予國家高新技術企業，省級、國家級“綠色工廠”，省級健康企業，成都制造業、民營企業百強，成都市市長質量獎等。

北京海燕藥業有限公司成立于2004年2月，坐落于北京市中關村生命科學園內，是揚子江藥業集團在北方地區唯一的集研發、生產、市場推廣為一體的科工貿一體化，高技術、高成長全資子公司，被授予北京市科委認定的高新技術企業、首批入選北京生物醫藥產業跨越發展工程G20工程杰出成長企業、北京市發改委高新技術成果轉化基地、北京市呼吸疾病藥物工程技術研究中心等，并獲得國家級“綠色工廠”、國家綠色制造示范企業稱號。

廣州海瑞藥業有限公司成立于2004年，位于廣州高新技術產業開發區科學城，總占地面積約11萬㎡。公司固體制劑車間通過歐盟GMP認證，凍干粉針劑車間通過澳大利亞TGA認證。先后獲得國家火炬計劃重點高新技術企業、中國化學制藥行業工業企業綜合實力百強、廣東省創新型企業、廣州市行業領先企業、廣州市創新標桿企業、廣州市民營領軍企業、瞪羚企業等稱號。連續5次奪得國際質量管理小組競賽最高獎項(ICQCC)金獎或鉑金獎。

江蘇龍鳳堂中藥有限公司成立于2014年，2018年全面投產運營，坐落于泰州市高港區永安洲鎮，占地面積1564畝，現有員工1300人。公司建成的現代化檢驗檢測研究中心獲得CNAS認可，并獲批國家發改委“中藥質量安全檢測及全過程溯源公共服務平臺”。先后完成國家工信部“中藥流程制造智能工廠新模式應用項目”和國家標準委“中藥流程智能制造國家高新技術產業標準化試點”。持續開展藥材質量標準研究，相繼獲得中成藥類3項國家科技進步二等獎，承擔了15個中藥材《歐洲藥典》植物專論研究工作，其中5個品種已順利載入《歐洲藥典》，為中藥標準國際化做出了開創性貢獻。

江蘇海慈生物藥業有限公司于2004年投資興建，坐落于泰州醫藥高新區濱江工業園內，是集團化學原料藥研發、中試和生產基地；現已形成占地460畝的海慈生產基地和占地348余畝的海濟生產基地，共有員工700余人。公司致力于高附加值原料藥技術研究、生產和銷售，并在創新藥、CDMO/CMO等領域廣泛開展對外合作。相繼榮獲國家高新技術企業、江蘇省瞪羚企業、江蘇省小巨人企業、江蘇省綠色發展領軍企業、科技創新十佳示范企業等榮譽。

江蘇海濟藥業有限公司于2017年投資興建，地處揚子江畔的永安洲，總占地348余畝，擁有普藥原料1號車間、綜合倉庫、動力中心、質檢樓、中控樓等多棟主體建筑，完全具備中試研究、商業化生產等產品生命周期保障能力。海濟藥業是集團原料藥布局的又一重要的藥物研發生產平臺，也是繼海慈公司之后，集團第二家化學原料藥的研發中試和生產基地，主要從事原料藥的研發和生產、高端及短缺輔料的研發和生產、原料藥技術轉移和CDMO業務。

江蘇制藥股份有限公司于1994年依江而生，總占地面積160余畝，是揚子江藥業集團首個獨立運營的子公司，為集團中藥產業板塊核心生產型子公司之一。公司通過三標一體、CNAS、測量體系、兩化融合、能源管理體系認證等，所有生產車間均通過GMP認證，其中2個車間榮獲“省級示范智能車間”，獲評“泰州市智能工廠重點培育企業”，憑借多年提取技術沉淀，建立市級“中藥提取工程研究中心”。公司先后被授予江蘇省綠色工廠、江蘇省綠色領軍企業、泰州市環保示范性企業等稱號。